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Illumina響應國研院國網中心科技抗疫 免費提供新冠病毒基因定序分析服務

為協助台灣應付新一波疫情對公衛、民生、經濟、教育等面向之衝擊與挑戰,科技部轄下的國家實驗研究院國家高速網路與計算中心(國研院國網中心)於本月初甫啟動科技抗疫2.0專案 ,釋出台灣杉系列超級電腦算力、儲存、大數據資料集及DAS資料分析平台等資源,免費開放各界提案申請運用抗擊疫情。今(6/21)日更進一步宣布,與全球基因定序的領導者Illumina¹攜手,提供專案申請者新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)病毒基因定序分析服務(COVIDSeq™),定序樣本數量無限制,且可以無償使用至20211231日,以透過分析病毒的基因定序資料,進行病毒監測、傳播鏈溯源,甚至用於疫苗開發研究。

次世代基因定序²是邁向新一代精準醫療或精準健康所需的關鍵核心技術,此技術不僅可用於人體及其他生物,也可用於病毒基因體的解碼。2020年初新冠肺炎(COVID-19)爆發初期,第一個SARS-CoV-2病毒基因體即由 Illumina定序解密,使廠商得以快速開發核酸檢測(PCR)及mRNA疫苗。基因定序也是溯源檢測的一大利器,藉由分析完整的病毒基因圖譜,有助基因序列比對,確認感染者之間的關聯性,並可以觀察是否有新的病毒株產生,找出新的突變位點。

在科技抗疫2.0專案中,國研院國網中心提供的高速基因序列分析設備及平台運算環境,輔以Illumina提供的COVIDSeq™免費分析流量,可支援國內各大基因定序實驗室、基因體中心、產業界,一天最高處理6,000多個檢體,讓檢體基因定序的研究量能大幅提升,為疫調分析、病毒演化或疫苗開發提供科學上的證據及助益。

科技部吳政忠部長表示,對抗疫情不分國界,Illumina是國際指標性的基因定序技術領導者,科技部引進國際資源,促進公私協力,期以科技共同助力臺灣抗疫工作。國研院國網中心史曉斌主任表示,Illumina的加入為國內研究病毒基因定序分析工作帶來強力奧援,透過超級電腦快速進行病毒分析,將為國內帶來更大抗擊新冠疫情的能量來應對病毒變異之威脅。

¹ llumina, Inc. (ILMN.US)爲全球基因定序的產業龍頭,成立於1998年,總部設在加州的San Diego。該公司提供了一系列的脫氧核糖核酸的陣列和RNA分析應用,包括單核苷酸多態性基因分型、拷貝數目變異分析、基因表現分析,與甲基化分析,以及允許單個陣列上已知的基因標記的檢測。此外,該公司還提供各種文庫製備和測序工具包以簡化工作流程加快分析,還有基因組定序、基因分型和無侵入產前檢測服務。服務對象包含基因組研究中心、學術機構、政府實驗室和醫院,以及醫藥、生物技術、農業基因組合、商業分子診斷實驗室和消費者基因公司。該公司銷售和直接分銷售其產品給在北美、歐洲、拉美和亞太地區的客戶,同時也透過生命科學的分銷商提供服務。

² 次世代定序( Next Generation Sequencing, NGS):是指傳統定序法的改良版,可進行高速大量且高精度的核酸定序。